本课程由4部分组成，从生命是什么？作为一个铺垫导入主题，通过介绍生命的基本特征、看不见的生命以及海洋里看不见的生命来进行详细阐述，再深入到海洋深部，通过科考发现黑暗生命的发现历程、主要类型和代谢特征、典型环境和特征、探测和研究技术发展的内容，结合综合大洋钻探计划（IODP）与深部生物圈探索，聚焦深部生物圈的古菌研究，为此展望深部生物圈研究面临的挑战等内容。